[[SHELXL]]
[[SHELXLを使ってみよう]]
#floatcontents
* SHELXLクックブック [#f6f4d0a0]
高分解能の構造解析のアーミーナイフ、SHELXL。使いこなしていませんが、メモ書きを増やしていきたいと思います。~
&color(red){作成中};
** XDSの構造因子データをSHELXで使いたい [#a406e88c]
:問題|XDSで処理したデータをSHELXで使いたい
:解法|
xdsconvを使ってSHELX形式のHKLファイルを作成します。
** 水素原子を発生させるときにエラーが出る [#s002a415]
:問題|水素原子を発生させるときに''BAD AFIX CONNECTIVITY: N_1028a BONDS TO CA_1028a''というようなエラーが出る
:解法|
insファイルでN末端の水素の定義を行います。
REM Remove 'REM' in following to activate H-atom generation
HFIX 137 N_1028 <-- これを追加(エラーが出た残基番号にあわせる)
HFIX_ALA 43 N
HFIX_ALA 13 CA
...
N末端が適切に処理されていないのが問題になるようです。とりあえず末端として水素原子を発生させるようにするとエラーは解消されます。
** 共有結合距離を実験的に求めたいので束縛をはずしたい [#a4f633b0]
** ESDを求めたい [#va925ff8]